Programme préliminaire

17h00 - 20h00

- Cesar de la Fuente, University of Pennsylvania, Philadelphie, États-Unis
Accelerating antibiotic discovery with AI

Résumé
 

- Sylvie Rebuffat, Muséum national d'Histoire naturelle, Paris, France
The continuous story of bacteriocins until emerging origins and methods for discovery

Résumé

8h30 - 17h30

- Laurent Bazinet, Université Laval, Québec, Canada
Combining statistical, machine learning and experimental approaches for screening of novel antimicrobial peptides from complex hydrolysates 

 Résumé 
 

- Éric Biron, Université Laval, Québec, Canada
The lipopeptide brevibacillin: A promising scaffold for the development of antimicrobials with tunable pharmacological properties and spectra of activity

 Résumé 
 

- Frédéric Borges, Université de Lorraine, Nancy, France
Top-down strategies for engineering microbial communities with antimicrobial properties

 Résumé 
 

- Françoise Coucheney, Université de Lille, Villeneuve d'Ascq, France
Bacteriocins from Lacticaseibacillus paracasei CNCM I-5369: anti-Escherichia coli activity, original export system, potential medical application

 Résumé 
 

- Véronique Delcenserie, Université de Liège, Liège, Belgique
Dynamic gastrointestinal models as engineering tools to decipher food-microbiome-probiotic interactions

 Résumé 
 

- Séverine Zirah,Muséum national d'Histoire naturelle, Paris, France
Microcin diversity and role in competitive interactions in poultry microbiota

 Résumé 

8h30 - 22h00

Ismail Fliss, Université Laval, Québec, Canada
 

 Résumé 
 

Simon Heilbronner, Ludwig-Maximilians-Universität München, Planegg-Martinsried, Allemagne
Feast or Famine: Nutrient Sharing Affects S. aureus Growth in the Nasal Ecosystem

 Résumé 


Sunday Ochai, International Center for Antimicrobial Resistance solutions, Copenhague, Danemark
AMR in a Changing Environment: Bridging Evidence, Policy, and practice Gaps at the Climate-AMR Nexus in Low- and Middle-Income Countries

 Résumé 

8h30 - 16h30

Workshop: Approches intégratives et intelligence artificielle pour la recherche d'antimicrobiens

Animatrice: Séverine Zirah, Muséum national d'Histoire naturelle, Paris, France

Cet atelier proposera une expérience immersive conçue pour familiariser les participants avec la diversité des ensembles de données « omiques » ainsi qu’avec les principes de classification et d’apprentissage automatique appliqués à la recherche sur les antimicrobiens.

Après une introduction aux méthodes multi-omiques ainsi qu'aux méthodes de classification et d'apprentissage automatique, un atelier pratique sur ordinateur utilisera un ensemble de données compilé à partir d'une collection de souches d'Enterobacteriaceae résistantes aux antibiotiques (1,2). L'analyse conjointe des données phénotypiques (activités antimicrobiennes des bactériocines) et des données génomiques visera à générer des outils permettant de prédire la sensibilité des souches aux bactériocines, suivie d'une évaluation de leur pertinence.

Références: 
1. Telhig S, Pham NP, Ben Said L, Rebuffat S, Ouellette M, Zirah S, Fliss I. Exploring the genetic basis of natural resistance to microcins. Microb Genom. 2024,10:001156. doi: 10.1099/mgen.0.001156. 
2. Telhig S, Ben Said L, Torres C, Rebuffat S, Zirah S, Fliss I. Evaluating the Potential and Synergetic Effects of Microcins against Multidrug-Resistant Enterobacteriaceae. Microbiol Spectr. 2022, 10:e0275221. doi: 10.1128/spectrum.02752-21. 

Aperçu du programme

Les thèmes de session suivants seront abordés dans le cadre du symposium:
 

1. Outils innovants pour le criblage et la prédiction

2. Ingénierie du microbiome

3. Découverte et conception de nouveaux antimicrobiens

4. Résistance aux antibiotiques et nouvelles alternatives

5. Nouveaux défis pour les innovations en matière de résistance aux antimicrobiens