Programmation

Programme préliminaire

16h00	Mot de bienvenue
16h20	Cesar de la Fuente, University of Pennsylvania, États-Unis Accelerating antibiotic discovery with AI Résumé
17h20	Sylvie Rebuffat, Muséum national d'Histoire naturelle, France The continuous story of bacteriocins until emerging origins and methods for discovery Résumé
18h20	Cérémonie d'ouverture

Session 1: Outils innovants pour le criblage et la prédiction Modérateurs: à déterminer
8h30	Wananit Wimuttisuk, National Science and Technology Development Agency (NSTDA), Pathum Thani,Thaïlande Metabolomic variation along the gastrointestinal tract of shrimp with white feces syndrome Résumé
8h50	Laurent Bazinet, Université Laval, Québec, Canada Combining statistical, machine learning and experimental approaches for screening of novel antimicrobial peptides from complex hydrolysates Résumé
9h10	Séverine Zirah, Muséum national d'Histoire naturelle, Paris, France Microcin diversity and role in competitive interactions in poultry microbiota Résumé
9h30	Yesmine Sahnoun, Université Laval, Québec, Canada Rapid bioinformatics and machine learning based identification of respiratory bacterial pathogens to assist antimicrobial stewardship Résumé
9h50	À confirmer Résumé
10h10	Pause, session d'affiches et réseautage
Session 2: Découverte et conception de nouveaux antimicrobiens Modérateurs: à déterminer
10h40	Anna Aris, Institute of Agrifood Research and Technology, Caldes de Montbui, Espagne Concatenating Bacteriocins as an antibiotic alternative for ruminants and aquaculture Résumé
11h00	Kitiya Vongkamjan Aurand, Kasetsart University, Bangkok, Thaïlande Isolation and characterization of novel broad-host range Vibrio phages for phage-based biocontrol formulation for the treatment of early mortality syndrome in shrimps Résumé
11h20	Éric Biron, Université Laval, Québec, Canada The lipopeptide brevibacillin: A promising scaffold for the development of antimicrobials with tunable pharmacological properties and spectra of activity Résumé
11h40	Françoise Coucheney, Université de Lille, Lille, France Bacteriocins from Lacticaseibacillus paracasei CNCM I-5369: anti-Escherichia coli activity, original export system, potential medical application Résumé
12h00	Lucie Beaulieu, Université Laval, Québec, Canada Screening of algal extracts antimicrobial activity for cheese preservation and characterization of active extracts Résumé
12h20	Mohammed Rhouma, Université de Montréal, Saint-Hyacinthe, Canada First steps toward the discovery of a new generation of veterinary-specific tetracyclines: The case of oxytetracycline degradation products Résumé
12h40	Déjeuner

Session 3: Ingénierie du microbiome Modérateurs: à déterminer
14h00	Frédéric Borgues, Université de Lorraine, Nancy, France Top-down strategies for engineering microbial communities with antimicrobial properties Résumé
14h30	Véronique Delcenserie, Université de Liège, Liège, Belgique Dynamic gastrointestinal models as engineering tools to decipher food-microbiome-probiotic interactions Résumé
Session 4: Résistance aux antibiotiques et nouvelles alternatives Modérateurs: à déterminer
14h50	Simon Heilbronner, LMU Munich, Munich, Allemagne Feast or famine: Nutrient sharing affects S. aureus growth in the nasal ecosystem Résumé
15h20	Ismail Fliss, Université Laval, Québec, Canada Résumé
15h40	Margaret Crumlish, University of Stirling, Stirling, UK Tracking Resistance: Phenotypic and Genomic Insights into Antimicrobial Resistance in Aquatic Bacterial Pathogens in Vietnam Résumé
16h00	Pause, session d'affiches et réseautage
16h30	Nguyen Giang Thu Lan, Asian Institute of Technology, Pathum Thani, Thaïlande Reducing antibiotic use in tilapia aquaculture through scalable vaccination strategies Résumé
16h50	À confirmer

Session 4: Résistance aux antibiotiques et nouvelles alternatives (suite) Modérateurs: à déterminer
8h30	Mario Pablo Estrada, Center for Genetic Engineering and Biotechnology (CIGB),Havane, Cuba Fighting antimicrobial resistance in aquaculture: new findings on PACAP antibacterial activity support host defense peptides as alternatives in aquaculture Résumé
8h50	Shafiq Ur Rehman, University of the Punjab, Lahore, Pakistan Assessment of Bacteriophage cocktails (Sal-Pak-1 and Sal-Pak-2) Efficacy against Salmonella Gallinarum Infection in Broiler Chicken Résumé
9h10	Warangkhana Songsungthong, National Science and Technology Development Agency (NSTDA), Pathum Thani, Thaïlande Universal Vibrio antigens stimulate shrimp immunity and protect shrimp against pathogenic Vibrio infection Résumé
9h30	Axel Pitard, Université de La Rochelle, La Rochelle, France Plant-Derived Antibacterials Against Multidrug-Resistant Pathogens: From Bactericidal Activity to Synergistic Combinations Résumé
Session 5: Nouveaux défis pour les innovations en matière de résistance aux antimicrobiens Modérateurs: à déterminer
9h50	Sunday O. Ochai, International Centre for Antimicrobial Resistance Solutions (ICARS), Copenhague, Danemark AMR in a Changing Environment: Bridging Evidence, Policy, and Practice gaps at the Climate - AMR Nexus in Low- and Middle- Income countries Résumé
10h20	Pause, session d'affiches et de réseautage
10h50	Ingrid Lynch Résumé
11h20	Road to Market: Table ronde Résumé
12h50	Remise des prix d'excellence d'affiches et mot de clôture
13h00	Lunch
14h30	Visite guidée (optionnelle)
19h00	Gala (optionnel)

8h30 - 16h30 Workshop réservé aux étudiants

Approches intégratives et intelligence artificielle pour la recherche d'antimicrobiens

Animatrice: Séverine Zirah, Muséum national d'Histoire naturelle, Paris, France

Cet atelier proposera une expérience immersive conçue pour familiariser les participants avec la diversité des ensembles de données « omiques » ainsi qu’avec les principes de classification et d’apprentissage automatique appliqués à la recherche sur les antimicrobiens.

Après une introduction aux méthodes multi-omiques ainsi qu'aux méthodes de classification et d'apprentissage automatique, un atelier pratique sur ordinateur utilisera un ensemble de données compilé à partir d'une collection de souches d'Enterobacteriaceae résistantes aux antibiotiques (1,2). L'analyse conjointe des données phénotypiques (activités antimicrobiennes des bactériocines) et des données génomiques visera à générer des outils permettant de prédire la sensibilité des souches aux bactériocines, suivie d'une évaluation de leur pertinence.

Références:
1. Telhig S, Pham NP, Ben Said L, Rebuffat S, Ouellette M, Zirah S, Fliss I. Exploring the genetic basis of natural resistance to microcins. Microb Genom. 2024,10:001156. doi: 10.1099/mgen.0.001156.
2. Telhig S, Ben Said L, Torres C, Rebuffat S, Zirah S, Fliss I. Evaluating the Potential and Synergetic Effects of Microcins against Multidrug-Resistant Enterobacteriaceae. Microbiol Spectr. 2022, 10:e0275221. doi: 10.1128/spectrum.02752-21.