Programmation

Programme préliminaire

16h00	Mot de bienvenue
16h20	Cesar de la Fuente, University of Pennsylvania, États-Unis Accelerating antibiotic discovery with AI Résumé
17h20	Sylvie Rebuffat, Muséum national d'Histoire naturelle, France The continuous story of bacteriocins until emerging origins and methods for discovery Résumé
18h20	Cérémonie d'ouverture

Session 1: Outils innovants pour le criblage et la prédiction Modérateurs: Rozenn Ravallec, Université de Lille, France et Laurent Bazinet, Université Laval, Canada
8h30	Wananit Wimuttisuk, National Science and Technology Development Agency (NSTDA), Pathum Thani,Thaïlande Metabolomic variation along the gastrointestinal tract of shrimp with white feces syndrome Résumé
8h50	Laurent Bazinet, Université Laval, Québec, Canada Combining statistical, machine learning and experimental approaches for screening of novel antimicrobial peptides from complex hydrolysates Résumé
9h10	Séverine Zirah, Muséum national d'Histoire naturelle, Paris, France Microcin diversity and role in competitive interactions in poultry microbiota Résumé
9h30	Yesmine Sahnoun, Université Laval, Québec, Canada Rapid bioinformatics and machine learning based identification of respiratory bacterial pathogens to assist antimicrobial stewardship Résumé
9h50	Pause, session d'affiches et réseautage
Session 2: Découverte et conception de nouveaux antimicrobiens Modérateurs: Ismail Fliss et Lucie Beaulieu, Université Laval, Canada
10h20	Anna Aris, Institute of Agrifood Research and Technology, Caldes de Montbui, Espagne Concatenating Bacteriocins as an antibiotic alternative for ruminants and aquaculture Résumé
10h40	Kitiya Vongkamjan Aurand, Kasetsart University, Bangkok, Thaïlande Isolation and characterization of novel broad-host range Vibrio phages for phage-based biocontrol formulation for the treatment of early mortality syndrome in shrimps Résumé
11h00	Éric Biron, Université Laval, Québec, Canada The lipopeptide brevibacillin: A promising scaffold for the development of antimicrobials with tunable pharmacological properties and spectra of activity Résumé
11h20	Françoise Coucheney, Université de Lille, Lille, France Bacteriocins from Lacticaseibacillus paracasei CNCM I-5369: anti-Escherichia coli activity, original export system, potential medical application Résumé
11h40	Lucie Beaulieu, Université Laval, Québec, Canada Screening of algal extracts antimicrobial activity for cheese preservation and characterization of active extracts Résumé
12h00	Mohammed Rhouma, Université de Montréal, Saint-Hyacinthe, Canada First steps toward the discovery of a new generation of veterinary-specific tetracyclines: The case of oxytetracycline degradation products Résumé
12h20	Déjeuner

Session 3: Ingénierie du microbiome Modérateurs: Séverine Zirah, Muséum national d'Histoire naturelle, France et Frédéric Borges, Université de Lorraine, France
14h00	Frédéric Borges, Université de Lorraine, Nancy, France Top-down strategies for engineering microbial communities with antimicrobial properties Résumé
14h30	Ismail Fliss, Université Laval, Québec, Canada Harnessing natural antimicrobial peptides to tackle Clostridium in the dairy sector: Breaking the transmission cycle from silage to cheese Résumé
Session 4: Résistance aux antibiotiques et nouvelles alternatives Modérateurs: Simon Heilbronner, LMU Munich, Allemagne et Carmen Torres, University of La Rioja, Espagne
14h50	Simon Heilbronner, LMU Munich, Munich, Allemagne Feast or famine: Nutrient sharing affects S. aureus growth in the nasal ecosystem Résumé
15h20	Margaret Crumlish, University of Stirling, Stirling, UK Tracking Resistance: Phenotypic and Genomic Insights into Antimicrobial Resistance in Aquatic Bacterial Pathogens in Vietnam Résumé
15h40	Nguyen Giang Thu Lan, Asian Institute of Technology, Pathum Thani, Thaïlande Reducing antibiotic use in tilapia aquaculture through scalable vaccination strategies Résumé
16h00	Axel Pitard, Université de La Rochelle, La Rochelle, France Plant-Derived Antibacterials Against Multidrug-Resistant Pathogens: From Bactericidal Activity to Synergistic Combinations Résumé
16h20	Session d'affiches et réseautage

8h30 - 16h30 Workshop réservé aux étudiants

Approches intégratives et intelligence artificielle pour la recherche d'antimicrobiens

Animateurs: Séverine Zirah, Muséum national d'Histoire naturelle, Paris, France et

Vivien Conti, Sorbonne Cluster for Artificial Intelligence, Paris, France

Cet atelier proposera une expérience immersive conçue pour familiariser les participants avec la diversité des ensembles de données « omiques » ainsi qu’avec les principes de classification et d’apprentissage automatique appliqués à la recherche sur les antimicrobiens.

Après une introduction aux méthodes multi-omiques ainsi qu'aux méthodes de classification et d'apprentissage automatique, un atelier pratique d'IA permettra de prédire l'activité antibactérienne de peptides à partir de leur séquence en acides aminés.

Cet atelier est organisé dans le cadre du programme de recherche international AviBiocin2 financé par le Centre de Recherches pour le Développement International (CRDI) et a bénéficié de bourses de l'Association de Chimiothérapie Anti-Infectieuse (ACAI).