Après avoir obtenu un doctorat en 2005 portant sur la génétique de Streptococcus thermophilus à l'Université Henri Poincaré de Nancy, en France, Frédéric Borges a occupé un poste de post-doctorant à l'Université d'Ulm en Allemagne de 2005 à 2007, afin de déchiffrer les facteurs d'adhésion du Streptococcus agalactiae. Depuis 2007, il est professeur et développe ses recherches en microbiologie alimentaire au Laboratoire d'ingénierie biomoléculaire LIBio, tout en enseignant la microbiologie, la biotechnologie et les statistiques à l'ENSAIA - Université de Lorraine. Ses activités de recherche se concentrent sur l'ingénierie des écosystèmes alimentaires fermentés, avec pour objectif principal de développer des stratégies innovantes pour utiliser les cultures de communautés microbiennes présentant un intérêt pour l'industrie alimentaire. En mettant particulièrement l'accent sur la biocoservation, ses recherches visent à améliorer la sécurité alimentaire et à prolonger la durée de conservation, contribuant ainsi à la réduction du gaspillage alimentaire.